Los electroduendes existen.
Tuve una alarma compacta que llevé a infinidad de reparadores de electrónica por un fallo rarísimo que tenía y ninguno fue capaz de darme una solución.
Era un circuito bastante elemental con no demasiados componentes, pero nadie sabía como digo repararla.
Resuelto a experimentar por mi cuenta, ya que su destino era el vertedero, averigüé por casualidad que era un diodo que no hacía su función.
Quiero decir con todo esto, que seguramente sea la cosa más tonta del mundo la que te esté causando el problema, pero sumamente indetectable.
Espero que tengas la misma suerte que tuve yo y des con el duendecillo que te está haciendo la puñeta.

Edito:
Se me ocurre que eches un vistazo al alojamiento de los fusibles correspondientes a los USBs cuando esté caliente el coche. No me extrañaría que haya un mal contacto al dilatarse por el calor y sea eso lo que está produciendo el fallo.
Un saludo y suerte de nuevo.